二十世纪初的日本太正时代，自明治维新以来的文明开化已进行了五十余年。　　随着西洋文化和日本传统文化的交汇融合，帝都(dōu )·东京逐渐(jiàn )成为(wéi )现代化建筑鳞次栉比，蒸汽铁道、地下铁道纵横交错，马车(chē )、人力车(chē )、蒸汽车川流不息的繁华都市。然而，这也是一座(zuò )有着怪物和咒(zhòu )术等非现实(shí )存在的魔幻都市。　　为了对抗从地底出现的强大魔物“降魔”，陆军成立了由将校中的灵能(néng )者组成的特殊部队——对降魔部队，成员即“二刀二剑”的4位继承者：米田一基，持有 “神刀·灭却”；山崎真之介，持有“光刀·无形”；藤枝菖蒲，持有“神剑·白羽鸟”；真宫寺一马，持有“灵剑·荒鹰”。四人仅凭自己的血肉之躯和手中的(de )神剑与魔(mó )物作战，史称“降魔战争”。激战的结果，陷入绝境的对降魔部队被迫使出最后的(de )手段——利用“魔神器”发动“破邪之血(xuè )”。魔神(shén )器即日本(běn )上古时代流传下来(lái )的三种祭器：剑、珠、玉，可以成为魔力的增幅器。继承真宫寺家“破邪之血”的一马，以自己(jǐ )的生命为代价用魔神器将降魔们封印，而山崎真之介也在此战中失踪……　　太正十一年，以(yǐ )妖僧天海为首的邪恶组织“黑之巢会”蠢蠢欲(yù )动。仇视近代文明(míng )的天海为了复辟德川幕府的统治，率领手下的死天王葵叉丹、弥(mí )勒、修罗(luó )、罗刹，操纵着利用古代咒法生出的魔物——魔操机兵在帝都展开了破坏活动。为了对抗这新(xīn )的威胁、守护帝都和民众，在花小路伯爵(jué )的大力支持下，新的政府直属对降魔组织——帝国华击(jī )团（简称“帝击”）·花(huā )组成立了。在米田一基(jī )、藤枝(zhī )菖蒲(pú )的领导下，花组集结了6名具备高灵力的少(shǎo )女：真宫寺一马的女儿、灵剑·荒鹰的继承者真宫寺樱；神崎财阀总帅忠义的孙女、精通神崎风尘流长刀术的神崎堇(jǐn )；俄国革命的勇士、曾有“食火鸟”之称的玛丽亚·橘；自幼就因超常的灵力被与世隔绝、年仅10岁的法国贵族千金爱丽丝；在辛亥革命的战乱中失去亲人、精通机械的中国少女李红兰；以及桐岛流空手的正统传人、身高近 2米的桐岛神奈。同时，基于山崎真之介留下(xià )的设计，由神崎重工完成了对降(jiàng )魔用灵子甲胄“光武”。以银座(zuò )大帝国剧场为基地、平日(rì )以歌剧团面目出现来掩人耳目的花组，在魔物出现时就会变为守护帝(dì )都(dōu )的战士，驾驶光武与敌人作战。　　太正十二年春，苦于战力及协作性不足的花组来了一位新队长——海军少尉大神一(yī )郎，《樱花大战》的故(gù )事也就从这里(lǐ )开始了……