某年的圣诞夜，大批民众聚集到某栋大厦门外，抗议国家(jiā )与库赞(zàn )共和国的纯净水合作计划。与此(cǐ )同时，交通网(wǎng )络以及相关(guān )电子系统遭到入侵而全面失灵，随(suí )后更有维持(chí )治安的警察掏枪射击抗议(yì )民(mín )众。值此危急时刻，公安九课少校的草薙素子（坂本真绫 配音）率领队员巴特（松田健一郎 配音）、陀古萨（新垣樽助 配音）等人迅速展开行动，与恐怖分子和黑客展开连番恶斗。这支个性满满且身怀绝技的机动(dòng )部队，还要追溯到2027年6月的某天。时任陆军机密部队501机关中佐的真室在街头被人杀害，公安9课课(kè )长荒卷大辅（塾一久 配音）在墓地与生化人草薙素子首次邂逅。后者接受荒卷的委托追(zhuī )查真相，在这一过程中和巴特等人邂逅。这(zhè )正是一段传奇部队“攻壳机动队”成立前夕的故事(shì )……　　本片根据士郎正宗的原作改编。