琴（法米克·詹森 Famke Janssen 饰）的死亡在X战警中造成了持续的影响，斯科特和金刚狼罗根（休•杰克曼 Hugh Jackman 饰）恍然若(ruò )失。学院的教学任务落在了风暴女（哈莉•贝瑞 Halle Berry 饰）和金(jīn )刚狼等人的肩上，异种人在这里才能得到身份的(de )认同。某公司从一名异种人儿童的基因中(zhōng )提取出了还原变异的X基因的“解药”，可以令异种人(rén )的身体与常人(rén )无异，解药的问世在异种人中引起了强烈反响，万磁王（伊安•麦克莱恩 Ian McKellen 饰）四处(chù )联系不愿改变体质的异种人，试图用暴力反抗人类社会的不公平待遇。金刚(gāng )狼等人发现琴并未死去，而且她被唤醒的第二重人格拥(yōng )有极(jí )为强大的力量，X教授（帕特里克•斯图尔特(tè ) Patrick Stewart 饰(shì )）和万磁王各自争取(qǔ )琴，她成为了改变异种人世界的关键(jiàn )人物…