二十世纪初的日本太正时代，自明治维新以来的文明开化已进行了五十余年。　　随着西洋文化和日本传统文化的交汇融合，帝都·东京(jīng )逐渐成为现代化建筑鳞次栉比，蒸汽铁道、地下铁道纵横交错，马(mǎ )车、人力车(chē )、蒸汽车川流不息的繁华都市。然而，这也是一座有着怪物和咒术等非现实存在的魔(mó )幻都市。　　为了对抗从地底出现的强大魔物“降魔”，陆军成立了(le )由将校中的灵能者组成的特殊部队——对降魔部队，成员即“二刀二剑”的4位继承者：米田一基，持有 “神刀·灭却”；山崎真之介，持有“光刀·无(wú )形”；藤枝菖蒲，持有“神剑·白羽(yǔ )鸟”；真宫寺一马，持有(yǒu )“灵剑·荒(huāng )鹰”。四人仅凭自己的血肉之躯和手中的神剑与魔物作战(zhàn )，史称“降魔战(zhàn )争”。激战的结果，陷入绝境的对降魔部队被迫使出最后的手段——利用“魔神器”发动(dòng )“破邪之血”。魔神器即日本上古时代流传下来的三种祭器：剑、珠(zhū )、玉，可以成为魔力的增(zēng )幅器(qì )。继承真宫寺家“破邪之血”的一马，以自己的生命为(wéi )代价用魔神器将降魔们封印，而山崎(qí )真之介也在此战中失踪……　　太正十一年，以妖僧(sēng )天海为首的邪恶组织“黑之(zhī )巢会”蠢蠢欲(yù )动。仇视近代文明的天海为了复辟德川幕府的统治，率领手下的死天王(wáng )葵叉丹、弥勒、修(xiū )罗、罗刹，操纵着利用古(gǔ )代咒法生出的魔物——魔操机兵在帝都展开了破坏活动。为了对抗这(zhè )新的威胁、守护帝都和民众，在花小路伯爵的大力支持下，新的政府直属对降(jiàng )魔组织——帝国华击团(tuán )（简称“帝击”）·花组成立了。在米田一基、藤枝菖蒲的领导下，花组集结了6名具备高灵力的少女：真宫寺(sì )一马的女儿、灵剑·荒鹰的继承者真宫寺樱；神崎财阀总帅忠义的孙女、精通神崎风尘流长(zhǎng )刀术的神崎堇；俄国革命的勇士、曾有“食火鸟”之称的玛丽亚·橘；自幼就因超常(cháng )的灵力被与世隔绝、年仅10岁的法国贵(guì )族千金爱丽丝；在辛亥革命的战乱中失去亲(qīn )人、精通机(jī )械的中国少女李红兰；以(yǐ )及桐岛流空手(shǒu )的正统传人、身高近 2米(mǐ )的桐岛神奈。同时，基于山崎真之介留下的设计，由神(shén )崎重工完成了对降魔用灵子甲胄“光武”。以银座大(dà )帝国剧场为基地、平日以歌剧团面目出(chū )现来掩人耳目的花组，在魔物出现时(shí )就会变(biàn )为(wéi )守护帝都的战士，驾驶光武与敌人作战。　　太正十二年春，苦于战力及协作性不足的花组来了一位新队(duì )长——海军少尉大神一(yī )郎，《樱花大战》的故事也就从(cóng )这里开始(shǐ )了……