「超能干探」描写两位至交好友，陈一贤(xián )(郭晋安饰)及方志强(刘锡明饰)，两人至同道合一起考进了警察学校，后(hòu )又分发到同一单位服务。　　强生性善良没有心机，但处事有原则，不(bú )愿随波逐流(liú )，因此屡遭局内同僚排斥。而好友贤则恰相反，他聪明机伶，做人有手腕、心机深，起嫉妒心(xīn )重，为了名利不择手段，因(yīn )此很受同事长官器重。　　一次，强在缉捕行动中受伤，子弹贯穿心肺之间，奇迹式的存活下来，但却从此产生了(le )「超能力」。强连自己也不太能理解(jiě )为什么能够「以眼代手」、「移形换影」或「电(diàn )磁效应」。幸有一位奇人沈节(谷峰饰)，教强控制自己的(de )超能力。　　强与贤在一次缉捕歹徒的行动中，惊险万分，贤不慎受枪伤，而强则在危机中，不知不觉的使用了超能力逮捕获歹徒，强因而升职。　　阮雯原为贤之女友，她一心一意守(shǒu )在贤身旁，但贤却因(yīn )自私多次冷落阮雯，令阮雯若有所失。强自小暗恋雯，乃不时给予鼓励；雯不受贤重视，找强倾吐，两人爱苗渐滋生。　　贤嫉妒强的升职，雯又向贤提出分手，并坦言爱上贤，贤因此更加愤恨。强被长官(guān )指派为诱饵，险象环生中又以超能力捕(bǔ )获歹(dǎi )徒，此时，高人(rén )石龙(王龙威饰)出现，以高强的功力将歹徒灭口。　　贤亲眼目睹石龙的超能力，乃告知强，强一时大意，将子己拥(yōng )有超能力之事坦言告之；贤乃求见沈节，沈节一眼看穿贤心术不正，劝他勿接近石龙，以免误入魔道。　　但贤因公(gōng )事不(bú )顺遂，巧遇石龙，石龙(lóng )引诱他做徒弟，贤名利(lì )薰心，开始向(xiàng )石龙学习超能力。　　马凤儿(彭家丽饰)因偶然的机会，认识了强的母亲关静红(苏杏璇饰)，两人颇为投缘(yuán )，红不但将凤儿带回家，并要强照料凤儿。凤儿刁钻活泼，初时常捉弄强，但逐渐了解强的忠厚后，渐爱上强。贤因得知凤儿显赫的(de )身世，利用强(qiáng )结识(shí )凤儿，贤渐对凤儿产生(shēng )情愫，但凤儿却对贤没感觉，唯对强情有(yǒu )独钟。而雯虽屡遭凤儿言语及行动骚扰，却始终默默忍受。　　贤与强(qiáng )被分为不同的二组，共同(tóng )打击犯罪。但两组组长处事不合，导致两组人马处处抢功；在共同(tóng )追查一桩重大刑案时，石(shí )龙因参与其中，龙要胁贤干出(chū )杀人勾当，自此，贤身陷魔道而不能(néng )自拔。　　强之师父沈节原(yuán )是大陆公安，来港为逮捕超能力高人石龙回大陆受审。强在不屈不挠的(de )追查下，真相逐渐被解开，正(zhèng )当他掌握罪(zuì )证据，却被石龙拦截，龙正要向强下毒手时，幸好沈节赶到，虽打走了龙但却身受重伤。凤儿也为了救强而牺牲了生命。　　贤怕自己的事迹败露，不断以超能力杀人，并设计陷害强，强虽知贤种钟恶行，但顾念(niàn )往惜情谊，不愿与(yǔ )贤决裂。　　龙见贤事(shì )迹败露，认为贤已无利用价值，欲杀(shā )贤，幸得强与节搭救。贤不知悔改，反而悟得更深之魔法，将(jiāng )石龙除去(qù )，并做恶不断。　　强忍无可忍，故意将雯遣至美国(guó )，并将红送回(huí )乡(xiāng )下，在(zài )无后顾之忧后，痛下决定和贤(xián )展开一场生死大对决.....。