恐怖分子在一间教堂里散播病毒，导致俄罗斯东部一座城市完全(quán )消失。同样的噩运即将降临日本，日本警视厅严阵以待，并请18岁的天才黑客高木藤丸（三浦春马 Haruma Miura 饰）协助参与其中。藤丸的父亲也(yě )是警察，原本负责这起案件，后因卷入误杀事件而被通缉(jī )。恐怖组织的折原麻弥（吉濑美智子 Michiko Kichise 饰）以生物老师(shī )的身份进入到藤丸(wán )所在的高中，并监视着藤丸。为了保护妹妹小(xiǎo )遥生命安全，藤丸不得(dé )已答应(yīng )了恐怖组织的要求盗取发电厂管理员密码给对方。在百货公司里，致命的bloody—x病毒怀疑被小丑散播，警视(shì )厅出动所(suǒ )有人力，为求保住东京市，差点让所有人命丧当(dāng )地。幸好藤丸及时发现病毒是假(jiǎ )的，虚惊一场。但当所有人都暂时放下心来时，恐怖组织已经开始踏出真正的第一步。Bloody Monday，是所有死去的人最后说出的话，也是(shì )最(zuì )大(dà )的秘密与阴谋。