恐怖分子在一间教(jiāo )堂里散播病(bìng )毒，导致俄罗斯东部一座城市完全消失。同样的噩运即将降临日本(běn )，日本警视厅严阵以待，并请18岁的天才黑客高木藤丸(wán )（三浦春马 Haruma Miura 饰）协助参与其中。藤丸的父亲也是警察，原本负责这起案件，后因卷入误杀事件而被通缉。恐怖组织的折原麻弥（吉濑(lài )美智子 Michiko Kichise 饰）以生物老师的(de )身份进入到藤丸所在的高中，并监视着藤丸。为了保护妹妹小遥生命安全，藤(téng )丸不得已答应了恐怖组织的要求盗(dào )取发电厂管理员密码给对方。在百货公司里，致命的bloody—x病毒怀疑被小丑(chǒu )散播，警视厅出动所有人力，为求保住东京市，差点让所有(yǒu )人(rén )命丧当地。幸好藤丸及时发现病毒是假的，虚惊一场(chǎng )。但当所有人都暂时放下心来时，恐怖组织已(yǐ )经开(kāi )始踏出(chū )真正的第一步。Bloody Monday，是所有死去的人最后说出的话(huà )，也是最大的秘密与阴谋。