南宋年间，通古县前任县令为了一己私利，利用“河神”为幌子暗中掳掠儿童，百姓惶惶不安，在其蛊惑下纷纷相信用孩童(tóng )祭祀“河神”可以平息灾祸。宋慈受命来到通古，向(xiàng )百姓一再申明祭祀河(hé )神纯(chún )属无稽之谈，并保证一定会查出事情真(zhēn )相，他的到来使得老县令感觉到了威胁。在老县令的授意下，其党羽对宋慈阳奉阴违，并暗中施以压迫，企图神不知鬼不觉的将(jiāng )宋慈了结。在一波接一波的危(wēi )险降临在宋慈身上时，孩童还在不(bú )断失踪，这使得(dé )老百姓对宋慈失去了信任，逼宋慈赶紧祭河神。宋慈顶着多方的压力，抽丝(sī )剥茧地调查，利用自己高超的法医学手段让尸体“开口说话(huà )”，逐渐锁定了真凶，并发现了背后的(de )巨大阴谋。最终，宋慈不惜以(yǐ )性命相搏将真凶绳之以法。